Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcnkO88874 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CcnkO88874 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CcnkO88874 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcnkO88874 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcnkO88874 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcnkO88874 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
CcnkO88874 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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