Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cfdp1O88271 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms