Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Lnx1O70263 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms