Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Copb2O55029 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Copb2O55029 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Copb2O55029 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Copb2O55029 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Copb2O55029 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Copb2O55029 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Copb2O55029 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Copb2O55029 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Copb2O55029 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Copb2O55029 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Copb2O55029 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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