Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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Kcns1O35173 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Kcns1O35173 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Kcns1O35173 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Kcns1O35173 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Kcns1O35173 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Kcns1O35173 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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