Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Sec22bO08547 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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