Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r58G3X9U3 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms