Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Slc14a2-201ENSMUST00000025434 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samd1D3YXK1 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Acox2-204ENSMUST00000164598 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd1D3YXK1 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms