Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nipsnap3aB1AWZ3 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms