Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-M5A7VMS3 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms