Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Gm26957-201ENSMUST00000182645 977 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Gm46210-201ENSMUST00000218800 577 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Fthl17e-201ENSMUST00000096509 841 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Gm16537-201ENSMUST00000161529 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Itgb1bp1-202ENSMUST00000172834 801 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Gm12946-201ENSMUST00000122969 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Nqo2-203ENSMUST00000220844 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SetxA2AKX3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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