Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ88

Pnpla7, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla7A2AJ88 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnpla7A2AJ88 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnpla7A2AJ88 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnpla7A2AJ88 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnpla7A2AJ88 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnpla7A2AJ88 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnpla7A2AJ88 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnpla7A2AJ88 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnpla7A2AJ88 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnpla7A2AJ88 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnpla7A2AJ88 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnpla7A2AJ88 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnpla7A2AJ88 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnpla7A2AJ88 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnpla7A2AJ88 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnpla7A2AJ88 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnpla7A2AJ88 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnpla7A2AJ88 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnpla7A2AJ88 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnpla7A2AJ88 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnpla7A2AJ88 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnpla7A2AJ88 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnpla7A2AJ88 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnpla7A2AJ88 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnpla7A2AJ88 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnpla7A2AJ88 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnpla7A2AJ88 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnpla7A2AJ88 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnpla7A2AJ88 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnpla7A2AJ88 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnpla7A2AJ88 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnpla7A2AJ88 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnpla7A2AJ88 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnpla7A2AJ88 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnpla7A2AJ88 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pnpla7A2AJ88 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pnpla7A2AJ88 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pnpla7A2AJ88 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pnpla7A2AJ88 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pnpla7A2AJ88 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pnpla7A2AJ88 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pnpla7A2AJ88 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pnpla7A2AJ88 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pnpla7A2AJ88 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnpla7A2AJ88 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms