Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubl3Q9Z2M6 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
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