Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ilf3Q9Z1X4 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms