Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Rnf4Q9QZS2 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf4Q9QZS2 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
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