Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

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Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a3Q9QZS0 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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