Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Snai3Q9QY31 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.4 ms