Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ldb3Q9JKS4 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms