Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole3Q9JKP7 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole3Q9JKP7 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole3Q9JKP7 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole3Q9JKP7 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pole3Q9JKP7 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Pole3Q9JKP7 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Pole3Q9JKP7 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Pole3Q9JKP7 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Pole3Q9JKP7 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pole3Q9JKP7 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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