Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl39Q9JKF7 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms