Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gfra4Q9JJT2 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
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