Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ush1cQ9ES64 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Ush1cQ9ES64 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Ush1cQ9ES64 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ush1cQ9ES64 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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