Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE8

Tlnrd1, Talin rod domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlnrd1Q9ERE8 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tlnrd1Q9ERE8 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tlnrd1Q9ERE8 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tlnrd1Q9ERE8 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tlnrd1Q9ERE8 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tlnrd1Q9ERE8 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tlnrd1Q9ERE8 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tlnrd1Q9ERE8 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tlnrd1Q9ERE8 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tlnrd1Q9ERE8 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tlnrd1Q9ERE8 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.8 ms