Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnft1Q9DCN7 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms