Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Swt1Q9DBQ9 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Swt1Q9DBQ9 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms