Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pop5Q9DB28 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms