Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Mtfr1-204ENSMUST00000130645 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Gfm2-208ENSMUST00000161639 3157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Gtf3c6Q9D8P7 Gpr63-201ENSMUST00000038920 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Gtf3c6Q9D8P7 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Gtf3c6Q9D8P7 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Gtf3c6Q9D8P7 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 Npy1r-202ENSMUST00000212588 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Gtf3c6Q9D8P7 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gtf3c6Q9D8P7 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Gtf3c6Q9D8P7 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Gtf3c6Q9D8P7 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Gtf3c6Q9D8P7 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 AC115891.3-201ENSMUST00000219161 2472 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Lpin3-201ENSMUST00000040872 3458 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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