Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fip1l1Q9D824 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms