Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Phf6Q9D4J7 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Phf6Q9D4J7 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Phf6Q9D4J7 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Phf6Q9D4J7 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Phf6Q9D4J7 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Phf6Q9D4J7 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Phf6Q9D4J7 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Phf6Q9D4J7 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Phf6Q9D4J7 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Phf6Q9D4J7 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Phf6Q9D4J7 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Phf6Q9D4J7 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Phf6Q9D4J7 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Phf6Q9D4J7 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Phf6Q9D4J7 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Phf6Q9D4J7 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Phf6Q9D4J7 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Phf6Q9D4J7 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf6Q9D4J7 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf6Q9D4J7 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Phf6Q9D4J7 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf6Q9D4J7 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf6Q9D4J7 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf6Q9D4J7 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Phf6Q9D4J7 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf6Q9D4J7 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Phf6Q9D4J7 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Phf6Q9D4J7 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf6Q9D4J7 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf6Q9D4J7 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Phf6Q9D4J7 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf6Q9D4J7 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf6Q9D4J7 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf6Q9D4J7 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf6Q9D4J7 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf6Q9D4J7 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf6Q9D4J7 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf6Q9D4J7 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf6Q9D4J7 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf6Q9D4J7 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf6Q9D4J7 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf6Q9D4J7 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf6Q9D4J7 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf6Q9D4J7 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Phf6Q9D4J7 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Phf6Q9D4J7 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Phf6Q9D4J7 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Phf6Q9D4J7 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Phf6Q9D4J7 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Phf6Q9D4J7 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Phf6Q9D4J7 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Phf6Q9D4J7 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Phf6Q9D4J7 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Phf6Q9D4J7 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms