Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ccdc47Q9D024 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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