Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms