Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg3Q9CPX6 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms