Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nus1Q99LJ8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms