Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Ddb2Q99J79 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Ddb2Q99J79 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ddb2Q99J79 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Ddb2Q99J79 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Ddb2Q99J79 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Ddb2Q99J79 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Ddb2Q99J79 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Ddb2Q99J79 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Ddb2Q99J79 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Ddb2Q99J79 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Ddb2Q99J79 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Ddb2Q99J79 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Ddb2Q99J79 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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