Protein–RNA interactions for Protein: Q99J36

Thumpd1, THUMP domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd1Q99J36 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thumpd1Q99J36 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms