Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim11aQ99J19 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Smim11aQ99J19 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Smim11aQ99J19 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Smim11aQ99J19 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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Smim11aQ99J19 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Smim11aQ99J19 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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Smim11aQ99J19 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim11aQ99J19 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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