Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

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Length 742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Colec12Q8K4Q8 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Colec12Q8K4Q8 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Colec12Q8K4Q8 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Colec12Q8K4Q8 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Colec12Q8K4Q8 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Colec12Q8K4Q8 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Colec12Q8K4Q8 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Colec12Q8K4Q8 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Colec12Q8K4Q8 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Colec12Q8K4Q8 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Colec12Q8K4Q8 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Colec12Q8K4Q8 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Colec12Q8K4Q8 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Colec12Q8K4Q8 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Colec12Q8K4Q8 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Colec12Q8K4Q8 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Colec12Q8K4Q8 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Colec12Q8K4Q8 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms