Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OptnQ8K3K8 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms