Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MyripQ8K3I4 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MyripQ8K3I4 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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