Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Abcf3Q8K268 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
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