Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LgsnQ8CIX8 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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