Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cdkl1Q8CEQ0 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms