Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc38Q8CDN8 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc38Q8CDN8 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc38Q8CDN8 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc38Q8CDN8 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc38Q8CDN8 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc38Q8CDN8 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc38Q8CDN8 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc38Q8CDN8 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc38Q8CDN8 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc38Q8CDN8 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc38Q8CDN8 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc38Q8CDN8 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc38Q8CDN8 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc38Q8CDN8 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc38Q8CDN8 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc38Q8CDN8 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc38Q8CDN8 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc38Q8CDN8 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc38Q8CDN8 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc38Q8CDN8 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc38Q8CDN8 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc38Q8CDN8 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc38Q8CDN8 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc38Q8CDN8 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc38Q8CDN8 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc38Q8CDN8 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc38Q8CDN8 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc38Q8CDN8 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc38Q8CDN8 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc38Q8CDN8 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc38Q8CDN8 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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