Protein–RNA interactions for Protein: Q8C156

Ncaph, Condensin complex subunit 2, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcaphQ8C156 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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NcaphQ8C156 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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NcaphQ8C156 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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NcaphQ8C156 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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NcaphQ8C156 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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NcaphQ8C156 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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NcaphQ8C156 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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NcaphQ8C156 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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NcaphQ8C156 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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NcaphQ8C156 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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NcaphQ8C156 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NcaphQ8C156 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms