Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp54Q8BL06 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp54Q8BL06 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp54Q8BL06 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp54Q8BL06 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp54Q8BL06 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp54Q8BL06 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp54Q8BL06 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp54Q8BL06 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp54Q8BL06 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp54Q8BL06 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp54Q8BL06 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp54Q8BL06 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp54Q8BL06 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp54Q8BL06 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp54Q8BL06 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp54Q8BL06 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp54Q8BL06 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp54Q8BL06 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp54Q8BL06 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms