Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGY9

Slc5a7, High affinity choline transporter 1, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a7Q8BGY9 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Slc5a7Q8BGY9 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Slc5a7Q8BGY9 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Slc5a7Q8BGY9 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Slc5a7Q8BGY9 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Slc5a7Q8BGY9 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Slc5a7Q8BGY9 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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