Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Atg4dQ8BGV9 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Atg4dQ8BGV9 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Atg4dQ8BGV9 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Atg4dQ8BGV9 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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