Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms