Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Amigo1Q80ZD8 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Amigo1Q80ZD8 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Amigo1Q80ZD8 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Amigo1Q80ZD8 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Amigo1Q80ZD8 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Amigo1Q80ZD8 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Amigo1Q80ZD8 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Amigo1Q80ZD8 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Amigo1Q80ZD8 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Amigo1Q80ZD8 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Amigo1Q80ZD8 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Amigo1Q80ZD8 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
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