Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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NanogQ80Z64 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
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NanogQ80Z64 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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NanogQ80Z64 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11□□□□□ -0.65
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NanogQ80Z64 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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NanogQ80Z64 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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NanogQ80Z64 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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NanogQ80Z64 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NanogQ80Z64 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms